他一边派人去联络满桂一同出兵，一边在七月五日清晨，带领两万秦军由榆林出长城，进军土默特部。
土默特部已经被林丹汗攻占，本来就没有多少防守力量了，孙传庭以秦军之中蒙古族士兵为首，让其带路，快速突击覆灭位于皇甫川的准格旗。
准格尔旗属于袄儿都司部，袄儿都司即鄂尔多斯，这一部分也被林丹汗攻占，而现在落到了明军手中。
安排一部分人手将所获牛羊马匹人员等押运到长城内，孙传庭继续向土默特右旗进发。
林丹汗的家眷和部署等都在土默特左旗以东的归化城之中。
那里距离大同是最近的。