近卫师团为黑旗军王德标所败，嘉义旋失，义勇首领徐骧殉难。日陆军自海上分别登陆台湾西岸及南端，海军陷旗后（高雄），风山不守，台南陷于重围。刘永福以援断饷绝，事不可为，西去厦门。十月二十一日（九月初四日），日军入台南。不及万人的义勇及黑旗军对抗数万人，明知势不相侔，仍能喋血奋战四月有余。日军初以为唾手可得台湾，及遭到勇猛抵抗，伤亡惨重，乃肆行屠杀，抢掠姦淫。所至人亡家破。台湾虽然沦陷，台人仍然不屈，在日本统治的半世纪中，台人的反日运动，始终未曾停止。