为中心呢?这就因为不但国民党反动派、特务分子仍然阴谋捣乱，农村封建恶霸势力仍然未曾摧毁，广大群众没有组织起来，而且散匪仍然继续潜伏活动，匪患仍然是新区农村的严重问题。”他认为：前一时期，陕西采取以军事清剿为主，结合政治争取瓦解和收编改造，已消灭了大股土匪。下一步要以发动群众、政治争取改造为主，配合军事清剿，肃清散匪，教育改造大批流散匪众、胁从分子，进而组织民兵，宝行自卫，巩固农村革命秩序，为进一步普遍发动群众，进行民主改革创造有利条件。他特别重视在剿匪中要发动群众，强调：只有老老实实把群众工作做好，匪患方可从根本上肃清。
这一时期，甘、宁、青、新等地都进行了大规模的军事剿匪斗争。一九五〇年春夏之交，甘肃平凉、宁夏固原等地的匪特分子(大多是国民党撤退时潜伏人员)，利用回汉民族的历史隔阂和当地干部执行政策中的缺点，挑拨民族关係，于五月八日组织武装暴动，抢劫商民，破坏治安，致使当地居民无法正常生活和进行生产活动，有四五万人逃往绥西地区。西北军政委员会即召开会议，分析研究匪情，提出清剿措施。习仲勋在会上说：这次暴乱，是国民党潜伏特务和当地匪徒有计划的破坏活动，必须引起我们严重注意，所有各级干部必须有明确的敌情观念，决不能轻视这些敌人，任何麻痹疏忽都会招致祸患。他要求西北军政委员会公安部立即作出具体部署，加强肃清匪特工作，同时利用各种有效办法，如慰问团、团结会等方式，深入宣传，平息骚动事件。加强民族团结，特别应注意做好干部整训工作，克服官僚主义和强迫命令作风。不久，他在中共中央西北局扩大会议上又进一步指出：“在剿匪问题上，任何性质的土匪，包括特务领导的武装暴动在内，都要当做群众问题看待。只有这样才能增强处理问题的谨慎态度和策略思想，而防止发生错误。对土匪要坚决消灭，这是原则。但应当采取怎样的步骤和办法才为正确，必须研究，否则不能达到消灭之目的。”“在新区，特别是少数民族地区，对任何土匪事件都要先防御、后进攻，先分化、后打击，先争取、后进剿，以及在必要情况下实行剿抚结合的办法。”