中央领导的嘱咐，多次讲话宣传西藏从来是中国领土的一部分，坚决维护汉藏民族的团结。
习仲勋关注着十世班禅回藏的情况，连新华社关于十世班禅回藏的报导稿也要亲自审阅，并作出批示。
一九八六年二月，十世班禅准备去西藏拉萨参加“传召”活动。二月五日下午，习仲勋约请十世班禅到中央统战部，就“传召”的有关问题与十世班禅交谈。习仲勋对“传召”活动考虑得很仔细，关切地说，这次你去拉萨主持祈祷大法会，这台戏你是主角，搞好搞不好，要看你了。这个法会二十年没搞了，今年开始恢復，意义很大。搞好了，对外影响更大。你去之前，要做好充分准备，把问题考虑周到些，对每件事的处理要儘量慎重点，安排妥当，时间短一点，规模小一点，儘量不要发生问题，通过这次活动扩大政治影响。习仲勋特别叮嘱说，大师千万要记住，你是全国人大常委会副委员长，处理任何事情，都要考虑可能产生的政治影响。并关照说，西藏情况很复杂，你要注意安全，确保不出事。一九八九年一月二十八日凌晨，十世班禅在西藏扎什伦布寺主持第五世至第九世班禅合葬灵塔祀殿——班禅东陵扎什南捷开光典礼后，因操劳过度，心臟病突发，抢救无效，英年早逝，终年五十一岁。噩耗传来，习仲勋十分震惊和悲痛。就在不久前十世班禅五十寿辰时，习仲勋还为之作“知天命之年”的祝贺，祝愿他为祖国为民族作出更辉煌的贡献。然而未料此次赴藏竞成不归。习仲勋痛心疾首地说，这个损失真是难以弥补啊!
二月二十目，习仲勋在《人民日报》着文，深切悼念十世班禅。文章深情地写道：