永历4年8月，孔有德率部杀向桂林，守卫桂林的就剩下曹志建和焦琏了。
曹志建率军迎敌，连战连败，被斩杀近万人，所部也被逼近徭峒中。
在击溃曹志建之后，孔有德率部继续逼近桂林城。
大敌当前，能担当起桂林守卫重任的也只剩下了开国公赵印选、卫国公胡一青手下的滇军了。
但赵印选、胡一青认为有恩于他们的何腾跤已死，大家没有义务去用鲜血和生命，去保卫那个“素无交情”的桂林留守瞿式耜，两人一琢磨，决定率部前往投奔贵州的忠义军，而被殷承柞整编为4部兵马
滇军的不战而遁，让瞿式耜直气得捶胸顿足骂道：““朝廷平时以高爵侍你们，百姓以膏血养你们，你们今天却不发一矢就四散而逃，可知头顶三尺有神灵”。
大骂之后瞿式耜决定以死报国，与张同敞一起取酒同饮，明烛达旦，然后在9月5日被大摇大摆进入桂...
摆进入桂林城的清军所俘获。
但瞿式耜、张同敞表现出传统士大夫的气节，一心求死的他们见孔有德根本不敢杀他们，最后竟然使出反间计让孔有德将他们自个儿杀死了。
在广州、桂林相继失守之后，南明顿时陷入空前危机，很多投机分子纷纷跳出来，以便分最后一杯羹。
先是永历帝亲信大将，假传圣旨的庆国公邦传看到瞿式耜已死，瞿式耜手下大将宣国公焦链靠山已倒，不顾蛮清大军压境之际，与儿子陈曾禹一道以宴客为名，斩杀前来做客的焦链，兼并其部众，成为南明兵力最强，最有实力的军阀。
陈邦传兼并行动引得很多正直将领非议，有的更是要治陈邦传之罪，在这种情况下陈邦传突然发兵准备劫持永历帝，如此退可以将永历帝作为礼物献给蛮清，自己高官厚禄，进可以劫持南明朝廷，以号令各位诸侯。
但永历帝朱由榔是天生的逃跑帝，在行军过程中发觉异常，当即率领侍卫逃出陈邦传围捕，向南宁方向逃去。
广州失守、桂林失守本来就非常惊爆，现在又爆出南明军队内讧，陈邦传派兵劫持永历帝朱由榔的事情，众人听后一片哗然。
兵政司侍郎赵荣贵摇头道：“如果我们情报无误，杜永和、李元胤可有十万大军，怎么能够困守孤城让鞑子轻易的攻破广州城呢？
还有，曹志建也有大军2万，赵印选、胡一清也有1万大军，焦链有2万大军，陈邦传有3万大军，孙可望有2万大军，大明在广西可足足有10万大军，怎么能够任由鞑子猖狂如斯？”
王国玺叹息道：“侍郎，南明军队你不是不知道，军队大多是老弱妇孺，真正能堪一战的不足一半，算得上精锐的更少啊，他们怎么像我们忠义军这样全都是精挑细选的忠义之士啊。
王爷组建忠义军，各部将士多为精锐死士，在战场上我们大家都可以身先士卒，但南明那帮老爷兵则不这样啊，还没有交战他们常常跑得老远啊。”
殷承柞摸着那半截胡须道：“王爷，如此观之，大明已亡亦。
说说也是，刚从肇庆回到梧州后不思进取，马上进行清洗，将袁彭年、金堡、蒙正发、刘湘客等人全部罢黜。
这次瞿式耜被杀之后，陈邦传马上兼并瞿式耜手下军队，南明如此行径让人寒心啊。
王爷，鞑子三王主力正在围攻两广，王爷应该率领主力东进，占领南京，截断长江，阻断鞑子主力归路啊。
钱邦芑嚷道：“王爷，鞑子三顺王倒行逆施，王爷当解救万民于水火啊。
东征万万不可，如此作为将影响王爷清誉亦。
虽然我等都知道大明已经连亡四次，但王爷一直奉大明为正朔，我等与永历帝有君臣之